A szűrőanyagok, mint a gyapjú vagy szivacsok fontos részét képezik a modern akvarisztikának. A szűrőgyapjúnak köszönhetően a durva szennyeződéseket felfogja, a szivacsok csökkentik a nitráttartalmat, megtisztítják a vizet a kémiai szennyeződésektől és optimális feltételeket biztosítanak a szűrőbaktériumok felhalmozódásához. Az aktív szén különösen alkalmas a csapvíz előkezelésére, a lebegő részecskék okozta zavarosság ellen, és nem utolsósorban a gyógyszeres kezelés utáni maradékok kiszűrésére, méregtelenítésre.